鹤林寺几经兴废，第一次毁于唐末薛朗刘浩之乱，第二次毁于明成祖永乐年间，第三次毁于清乾隆年间。乾隆十二年鹤林寺得以修复。鹤林寺里有桐城文宗方苞的重建鹤林寺的碑记，但是，上个世纪七十年代前后，镇江水泥厂占据寺庙，碑记是否还在，不得而知。
鹤林寺背后左右都是山，寺境清幽。门前是一片平畴，一湾流水。寺院的历史古远，历代的皇王卿相，文人墨士，多曾与鹤林寺有着相得益彰的典故和传说，遂使寺院胜迹佳话，传于千古而不朽。鹤林寺是镇江南郊最古老、寺院规模最大，古迹、典故最多的寺院。
成都鹤林禅院
寺院传说
唐朝诗人杜牧有诗云：南朝四百八十寺，多少楼台风雨中。南朝时期的镇江，寺庙众多，位于黄鹤山和磨笄山之间的鹤林寺始建于东晋元帝四年（公元321年），原名竹林寺，后改名鹤林寺，改名的原因是因为刘宋开国皇帝刘裕做了一个梦。
传说刘裕未做皇帝之前以砍柴谋生，有一天他在山里砍柴砍累了，躺着就睡着了，梦见许多黄鹤围着他转，这梦暗示他以后要做皇帝。刘裕后来果真做了皇帝，他龙颜大喜，将这座自己曾经梦见黄鹤的山命名为黄鹤山，将黄鹤山附近的竹林寺改名为鹤林寺。
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